Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Exo1Q9QZ11 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Exo1Q9QZ11 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Exo1Q9QZ11 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Exo1Q9QZ11 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exo1Q9QZ11 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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