Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndrg3Q9QYF9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms