Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd4Q9QY39 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd4Q9QY39 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms