Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1a1Q9QXZ6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Slco1a1Q9QXZ6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Slco1a1Q9QXZ6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Slco1a1Q9QXZ6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slco1a1Q9QXZ6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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