Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nufip1Q9QXX8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms