Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx8Q9QXV1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms