Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pcsk1nQ9QXV0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms