Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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