Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Limd1Q9QXD8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms