Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rai2Q9QVY8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms