Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms