Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoaQ9QUI0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms