Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms