Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms