Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CubnQ9JLB4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms