Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms