Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd3Q9JJY3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms