Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad9Q9JIW5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms