Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc22Q9JIG7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms