Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2ird1Q9JI57 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms