Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EefsecQ9JHW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EefsecQ9JHW4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms