Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap29Q9ERB0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap29Q9ERB0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms