Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms