Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn4aQ9ER60 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms