Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnn1Q9EQR3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnn1Q9EQR3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms