Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms