Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp2Q9EPK2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms