Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpr88Q9EPB7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms