Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms