Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms