Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smg9Q9DB90 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms