Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Znf580Q9DB38 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Znf580Q9DB38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Znf580Q9DB38 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Znf580Q9DB38 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Znf580Q9DB38 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Znf580Q9DB38 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf580Q9DB38 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf580Q9DB38 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf580Q9DB38 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf580Q9DB38 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf580Q9DB38 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf580Q9DB38 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf580Q9DB38 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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