Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TrmuQ9DAT5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmuQ9DAT5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TrmuQ9DAT5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms