Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd8Q9DA37 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms