Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms