Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms