Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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