Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9H8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9H8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9H8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9H8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9H8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9H8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9H8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9H8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms