Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms