Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms