Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms