Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tmem54Q9D7S1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tmem54Q9D7S1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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