Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clic3Q9D7P7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clic3Q9D7P7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms