Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9D7E4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms