Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13Q9D777 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms