Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins2Q9D600 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms