Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms