Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f1Q9D5Q6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms