Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3404Q9D506 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3404Q9D506 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms