Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933402D24RikQ9D4D3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms